Gplots Heatmap

  1. Gplots Heatmap Example
  2. Gplots Heatmap.2
  3. Gplots Heatmap R

Enhanced Heat Map

Description

A heat map is a false color image (basically image(t(x))) with a dendrogram added to the left side and/or to the top. Typically, reordering of the rows and columns according to some set of values (row or column means) within the restrictions imposed by the dendrogram is carried out.

Usage

Arguments

x

Details

If either Rowv or Colv are dendrograms they are honored (and not reordered). Otherwise, dendrograms are computed as dd <- as.dendrogram(hclustfun(distfun(X))) where X is either x or t(x).

Colors

Value

Invisibly, a list with components

Note

The original rows and columns are reordered in any case to
match the dendrogram, e.g., the rows by
order.dendrogram(Rowv) where Rowv is the
(possibly reorder()ed) row dendrogram.

Author(s)

Andy Liaw, original; R. Gentleman, M. Maechler, W. Huber,
G. Warnes, revisions.

See Also

hclust

R gplots heatmap.2

Examples

http://hosho.ees.hokudai.ac.jp/~kubo/Rdoc/library/gplots/html/heatmap.2.html

Gplots Heatmap

heatmap.2的更多相关文章

Gplots Heatmap.2

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